是的,水玲珑杯子商标已经注册。该商标已经在国家商标局进行了注册,并获得了商标注册证。水玲珑作为品牌已经得到了相应的法律保护,确保其在市场上的合法权益。消费者可以放心购买水玲珑杯子,因为它们已经得到了官方认可和保护。同时,该商标的注册也为企业在市场上的稳定发展和品牌建设提供了有力支持。